A Sega korábban már bejelentette, hogy az Uniloc másolásvédelmi rendszerét használja majd a dobozos és digitális verziókban, ma pedig a pontos részleteket is ismertette a kiadó.
A hivatalos bejelentés szerint a Uniloc: SoftAnchor védelem hivatott a kalózok ellen fellépni, a másolásvédelmi rendszer pedig mind a dobozos, mind a Steamen megvásárolható digitális verziókat védelmezi majd. Az Alpha Protocolt csupán egyszer kell aktiválni a Uniloc szerverein keresztül, összesen öt különböző számítógépre tehetjük majd ezt meg. A rendszer érdekessége, hogy az aktiválásokat bármikor visszavonhatjuk. Az Alpha Protocol május 28-án jelenik meg PC-re, X360-ra és PS3-ra.
